More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0368 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  100 
 
 		 425 aa  843    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  43.58 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  40.49 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  40.6 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  37.67 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  36.66 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  37.21 
 
 		 437 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  38.12 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  37.06 
 
 		 433 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  35.71 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  39.1 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 		 440 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  35.71 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  38.12 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  35.71 
 
 		 440 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  41.99 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  36.98 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  37.88 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  37.8 
 
 		 440 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  35.71 
 
 		 424 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  39.33 
 
 		 409 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  35.43 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  35.61 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  37.21 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  35.14 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  35 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  36 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.85 
 
 		 438 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 		 444 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  36.07 
 
 		 436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.36 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.45 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  38.75 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  37.8 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  37.47 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.97 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  35.25 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  35.01 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  35 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.58 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  34.98 
 
 		 425 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  33.56 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  36.3 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  35.27 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  36.54 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  36.06 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  34.85 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  34.2 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  35.66 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  36.3 
 
 		 411 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  37.02 
 
 		 411 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.9 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  34.43 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  36.01 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.01 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  36.01 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  36.01 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  36.88 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  34.43 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  34.43 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  34.43 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  34.43 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  34.43 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  35.31 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  35.31 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 437 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  33.41 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  33.41 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  33.41 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  41.49 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  34.67 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  33.41 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  35.35 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  35.97 
 
 		 409 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  33.65 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  33.65 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  33.65 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  33.65 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  35.9 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  37.4 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  36.13 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  36.13 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  37.4 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  35.07 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  36.13 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  36.68 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  34.91 
 
 		 442 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  35.61 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  36.13 
 
 		 416 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  34.19 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  36.83 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  35.42 
 
 		 410 aa  233  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>