More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1281 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  74.7 
 
 		 433 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  100 
 
 		 434 aa  856    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  74.25 
 
 		 434 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  74.48 
 
 		 434 aa  653    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  72.6 
 
 		 445 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  64.75 
 
 		 449 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  63.51 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  63.31 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  62.38 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  60.37 
 
 		 436 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  61.43 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  61.72 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  61.15 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.91 
 
 		 437 aa  524  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  59.19 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  59.43 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  59.43 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  59.43 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  59.47 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  58.95 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  58.99 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  62.06 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  59.67 
 
 		 441 aa  501  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  59.29 
 
 		 438 aa  494  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  54.69 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  53.1 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  53.81 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  55.61 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  54.05 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  50.47 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  46.35 
 
 		 424 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46.3 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46.53 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  46.12 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  46.12 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46.3 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  45.58 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  46.12 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  45.39 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  47.33 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  44.55 
 
 		 433 aa  363  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  45.39 
 
 		 425 aa  360  4e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  43.75 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  46.17 
 
 		 409 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  49.06 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  48.1 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  45.91 
 
 		 409 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  48.55 
 
 		 411 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  48.55 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  49.6 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  48.28 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  48.28 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  48.28 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  48.28 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  48.28 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  48.28 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  48.28 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  48.28 
 
 		 411 aa  338  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  41.75 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  40.63 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  40.57 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  42.09 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  44.56 
 
 		 437 aa  288  9e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  37.82 
 
 		 451 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.71 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.86 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  38.76 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.34 
 
 		 430 aa  279  8e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  41.79 
 
 		 409 aa  276  8e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  39.47 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  40.34 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  38.21 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0719  sodium:dicarboxylate symporter  41.28 
 
 		 418 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  41.52 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  40.59 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  40.59 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  45.6 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  40.59 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  39.1 
 
 		 425 aa  269  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  38.75 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3115  sodium:dicarboxylate symporter  40.67 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  40.89 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  38.27 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  41.11 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4004  proton/glutamate symporter, putative  40.59 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  38.13 
 
 		 409 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 414 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 414 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  37.65 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  40.14 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  38.07 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  42.98 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  40.38 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  37.29 
 
 		 416 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  37.2 
 
 		 416 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>