More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04867 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  85.91 
 
 		 433 aa  745    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  100 
 
 		 434 aa  855    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  74.25 
 
 		 434 aa  653    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  97.93 
 
 		 434 aa  837    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  73.6 
 
 		 445 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  60.37 
 
 		 436 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  62.41 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  60.77 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  61.1 
 
 		 436 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  61.78 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  58.72 
 
 		 442 aa  521  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  59.95 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  60.38 
 
 		 437 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  59.4 
 
 		 436 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  58.74 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  58.51 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  57.41 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  57.41 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  57.41 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  58.04 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  57.81 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  57.18 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  57.67 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  59.49 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  53.7 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  54.94 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  53.7 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  53.79 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  52.55 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  48.61 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  45.56 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46.48 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46.71 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46.71 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  46.48 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  50.67 
 
 		 443 aa  363  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  49.09 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  46.68 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  49.34 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  49.34 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  45.2 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  47.93 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  44.13 
 
 		 449 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  47.41 
 
 		 433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  45.01 
 
 		 409 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  47.83 
 
 		 417 aa  346  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  45.27 
 
 		 409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  45.38 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  45.45 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  44.83 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  44.83 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  44.83 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  44.33 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  44.33 
 
 		 411 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  43.24 
 
 		 424 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  43.72 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  43.69 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  39.05 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  41.76 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  42.64 
 
 		 451 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.8 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  38.28 
 
 		 413 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  42.12 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  40.51 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  43.28 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  40.52 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  38.99 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  41.36 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.13 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  41.91 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  41.48 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3115  sodium:dicarboxylate symporter  41.75 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  41.23 
 
 		 416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  42.17 
 
 		 414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  41.23 
 
 		 416 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  40.22 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4004  proton/glutamate symporter, putative  41.08 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  42.59 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  39.56 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  42.23 
 
 		 416 aa  266  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  42.4 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  36.62 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0671  sodium:dicarboxylate symporter  41.73 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  38.12 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  42.66 
 
 		 413 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>