More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0052 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  86.14 
 
 		 434 aa  750    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  85.91 
 
 		 434 aa  745    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  100 
 
 		 433 aa  856    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  74.7 
 
 		 434 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  71.73 
 
 		 445 aa  628  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  63.01 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  60.19 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  61.48 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  61.72 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  60.05 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  59.18 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  60.72 
 
 		 448 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  61.54 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.67 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  59.91 
 
 		 437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  59.44 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  58.35 
 
 		 440 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  58.35 
 
 		 440 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  58.35 
 
 		 440 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  59.44 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  58.35 
 
 		 440 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  58.69 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  59.3 
 
 		 441 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  59.72 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  53.55 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  53.55 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  54.5 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  55.4 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  54.37 
 
 		 452 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  46.65 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  46.04 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  49.59 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46.3 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46.3 
 
 		 444 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  46.47 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  48.5 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  48.5 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  48.5 
 
 		 435 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  45.74 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  46.37 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  45.11 
 
 		 433 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  44.77 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  47.29 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  44.28 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  46.15 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  47.98 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  45.54 
 
 		 411 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  46.53 
 
 		 411 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  46.53 
 
 		 411 aa  339  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  46.53 
 
 		 411 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.53 
 
 		 411 aa  338  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  46.53 
 
 		 411 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  46.53 
 
 		 411 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.54 
 
 		 411 aa  338  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  45.06 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  46.17 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  46.19 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  45.79 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  43.44 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  42.24 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  41.84 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  42.72 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  41.48 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.38 
 
 		 409 aa  285  9e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  41.5 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  43.37 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  42.93 
 
 		 441 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  42.44 
 
 		 416 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  41.3 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  43.8 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  39.22 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  40.76 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  42.3 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  41.67 
 
 		 421 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  42.11 
 
 		 417 aa  272  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3115  sodium:dicarboxylate symporter  41.99 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  41.51 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  42.26 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  41.64 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  42.78 
 
 		 413 aa  269  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 428 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  42.55 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  42.51 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  40.94 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  40.94 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  40.94 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 		 416 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  39.52 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  42.28 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  39.52 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  37.06 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>