More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0390 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 428 aa  834    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  49.53 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  46.3 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  47.24 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  45.37 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46.65 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46.65 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  46.41 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46.65 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  43.53 
 
 		 439 aa  335  7e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  45.08 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  45.08 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  45.08 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  48.41 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  44.12 
 
 		 449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  45.23 
 
 		 424 aa  329  7e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  44.36 
 
 		 443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  43.5 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  48.97 
 
 		 417 aa  326  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  46.93 
 
 		 409 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  43.65 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  43.78 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  44.42 
 
 		 410 aa  308  9e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0099  sodium:dicarboxylate symporter  43.03 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0216  sodium:dicarboxylate symporter  43.69 
 
 		 421 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.013646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  44.1 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  44.1 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  43.87 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  44.34 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  44 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  43.94 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  43.65 
 
 		 437 aa  295  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  43.58 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  41.2 
 
 		 409 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.69 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  43.06 
 
 		 442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  43.16 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  43.78 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.16 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  45.57 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  43.16 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.16 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  43.16 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  43.16 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  43.16 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  45.31 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  43.3 
 
 		 411 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  44.09 
 
 		 413 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  43.54 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  41.33 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  43.16 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  44.94 
 
 		 439 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  44.65 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  42.37 
 
 		 411 aa  279  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  42.86 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  45.05 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  43.52 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  43.87 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  45.31 
 
 		 449 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  40.42 
 
 		 429 aa  272  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  41.77 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  41.79 
 
 		 425 aa  269  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  43.15 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  41.75 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  39.26 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  42.89 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  45.22 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  39.26 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  44.92 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  39.52 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.52 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  39.52 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  39.25 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  39.05 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  39.05 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  39.05 
 
 		 423 aa  256  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  39.29 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  39.29 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  37.62 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  43.19 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  38.81 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  37.38 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  39.49 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  37.38 
 
 		 443 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  38.23 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  40.98 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  39.49 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  38.88 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  37.53 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  39.49 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  39.12 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  38.83 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  37.06 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  35.15 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  39.12 
 
 		 416 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  39.61 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>