More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0216 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0216  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 421 aa  805    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.013646 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  84.56 
 
 		 434 aa  687    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0099  sodium:dicarboxylate symporter  56.42 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  55.56 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  53.73 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  41.9 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  41.67 
 
 		 444 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  41.67 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  41.53 
 
 		 444 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  43.75 
 
 		 428 aa  294  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  38.71 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  40.38 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  39.28 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  40.38 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  40.38 
 
 		 440 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  39.66 
 
 		 443 aa  276  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  40.15 
 
 		 430 aa  275  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  40.59 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  38.85 
 
 		 432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  39.02 
 
 		 449 aa  269  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  42.72 
 
 		 429 aa  265  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  39.46 
 
 		 427 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  39.71 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  39.65 
 
 		 441 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  39.05 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  39.41 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  37.75 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  40.73 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40.37 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  39.41 
 
 		 410 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  40.75 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40.63 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  38.9 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  38.67 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  39.37 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.37 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  38.73 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  39.69 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  39.69 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  39.69 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  40.36 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  39.43 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  38.24 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  39.36 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  37.77 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  37.84 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  38.92 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.99 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  37.25 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  38.11 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  38.03 
 
 		 447 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  39.57 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  36.76 
 
 		 452 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  38.4 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.74 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  37.81 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.7 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  35.43 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.43 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.43 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  35.43 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  35.43 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  35.77 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  35.17 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.17 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  36.36 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.45 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  34.91 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  35.36 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  35.7 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  35.7 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  32.06 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  35.7 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  35.45 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  35.45 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  35.45 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  35.21 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  35.21 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  35.21 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  34.95 
 
 		 457 aa  202  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  36.81 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  34.95 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  32.86 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  32.86 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>