More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1224 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  85.43 
 
 		 413 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  84.54 
 
 		 419 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  85.02 
 
 		 419 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  85.02 
 
 		 419 aa  695    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  87.02 
 
 		 416 aa  708    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  83.13 
 
 		 441 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  87.65 
 
 		 426 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  86.8 
 
 		 417 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  87.04 
 
 		 417 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  85.22 
 
 		 416 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  87.02 
 
 		 427 aa  710    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  87.04 
 
 		 417 aa  683    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  84.07 
 
 		 417 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  85.02 
 
 		 419 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  85.02 
 
 		 419 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 416 aa  822    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  46.78 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 435 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  45.9 
 
 		 440 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  45.9 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  47.23 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46.99 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  45.17 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46.99 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  45.87 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  46.08 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  46.67 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  46.51 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  46.7 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  45.41 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  47.42 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  43.53 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  42.82 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  41.87 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.9 
 
 		 435 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  39.75 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40.47 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  40.33 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  40.09 
 
 		 440 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  40.09 
 
 		 440 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  40.09 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40.14 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.14 
 
 		 437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  39.66 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.57 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  42.66 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.02 
 
 		 437 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  39.2 
 
 		 413 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.16 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  41.64 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  40.37 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  38.68 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  40.7 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  41.37 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  40.7 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  40.97 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.97 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.97 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  40.97 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  42.23 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  40.97 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  39.04 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  40.43 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  40.7 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  40.43 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  42.23 
 
 		 434 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  38.16 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  41.05 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  40.16 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  39.48 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  41.07 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  39.58 
 
 		 447 aa  269  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  40.58 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  38.1 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  37.89 
 
 		 442 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  35.81 
 
 		 443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  35.71 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  35.71 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  37.32 
 
 		 445 aa  259  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  35.71 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  35.71 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  35.48 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  36.04 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  35.48 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  35.48 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  39.1 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  35.24 
 
 		 423 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  35.24 
 
 		 423 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  39.28 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  38.8 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  38.8 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  37.05 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  37.2 
 
 		 452 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  36.75 
 
 		 443 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  37.05 
 
 		 444 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  39.04 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>