More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1097 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 452 aa  889    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  63.12 
 
 		 457 aa  568  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  62.22 
 
 		 457 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  63.57 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  54.85 
 
 		 436 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  55.61 
 
 		 434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  50.23 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  50.23 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  50.9 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  50.23 
 
 		 440 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  52.72 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  52.61 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  50.23 
 
 		 440 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  54.37 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  51.36 
 
 		 437 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  51.7 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  50.69 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  50.69 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  52.55 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  52.55 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  50.46 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  52.11 
 
 		 436 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  51.12 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  49.31 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  49.66 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  51.74 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  51.42 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  48.99 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  46.54 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  45.61 
 
 		 409 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  47.12 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  40.63 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  40.41 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  40.41 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  40.18 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  42.96 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.82 
 
 		 411 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  41.53 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  44.82 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  44.82 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  44.58 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  45.11 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  45.06 
 
 		 411 aa  326  7e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  41.05 
 
 		 440 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  41.05 
 
 		 440 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  41.59 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  41.05 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  44.1 
 
 		 411 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 411 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  41.18 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 449 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  44.89 
 
 		 417 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  41.05 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  42.41 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  37.97 
 
 		 413 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  40.48 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  40 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  40.98 
 
 		 428 aa  259  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  36.89 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  38.6 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  38.4 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  37.08 
 
 		 417 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  36.93 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  36.68 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  38.89 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  36.43 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  39.4 
 
 		 416 aa  247  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  36.88 
 
 		 413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  38.03 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2949  sodium:dicarboxylate symporter  41.52 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  38.3 
 
 		 445 aa  246  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  34.78 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  34.28 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  37.99 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  34.5 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 		 414 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  35.71 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  35.71 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  38.52 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 416 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  35.71 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 416 aa  243  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 416 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 		 417 aa  242  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  35.71 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.36 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  35.93 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  35.27 
 
 		 437 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>