More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3995 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0216  sodium:dicarboxylate symporter  84.56 
 
 
421 aa  681    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.013646 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
434 aa  841    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  56.52 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  53.5 
 
 
433 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0099  sodium:dicarboxylate symporter  53.74 
 
 
430 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  51.57 
 
 
439 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  41.87 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  43.54 
 
 
428 aa  302  9e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  41.87 
 
 
444 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  41.87 
 
 
444 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  41.87 
 
 
444 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.86 
 
 
430 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 
433 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  39.81 
 
 
435 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  39.81 
 
 
440 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  39.81 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  37.89 
 
 
432 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  39.46 
 
 
449 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  42.89 
 
 
429 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 
443 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  39.08 
 
 
430 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  37.96 
 
 
432 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  39.41 
 
 
424 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  39.45 
 
 
409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  38.24 
 
 
416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 
437 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  36.76 
 
 
427 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  39.79 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  37.23 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  38.38 
 
 
417 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  36.21 
 
 
441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  39.19 
 
 
436 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  37.63 
 
 
442 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  38.05 
 
 
437 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  38.05 
 
 
437 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  37.9 
 
 
417 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  36.95 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  35.95 
 
 
413 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 
440 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  37.01 
 
 
419 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  37.01 
 
 
419 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  37.01 
 
 
419 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  37.01 
 
 
419 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 
409 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  37.79 
 
 
437 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 
436 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 
440 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 
440 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 
449 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  37.33 
 
 
439 aa  236  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  37.25 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  38.11 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  37.02 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  37.97 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.2 
 
 
437 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  36.52 
 
 
424 aa  233  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  38.17 
 
 
434 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  36.25 
 
 
417 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  36.25 
 
 
417 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  37.03 
 
 
433 aa  230  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 
441 aa  229  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  38.76 
 
 
448 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  35.77 
 
 
417 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  37.03 
 
 
434 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  36.25 
 
 
440 aa  227  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  36.72 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  36.46 
 
 
411 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 
416 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  33.25 
 
 
423 aa  223  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 
416 aa  223  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.94 
 
 
411 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  36.03 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  35.94 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.94 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.94 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  35.94 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  35.94 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.42 
 
 
411 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  36.84 
 
 
411 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  36.13 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  34.18 
 
 
445 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.22 
 
 
438 aa  216  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  34.99 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  36.98 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  34.74 
 
 
413 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  38.36 
 
 
437 aa  212  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  34.88 
 
 
457 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  34.37 
 
 
457 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  32.62 
 
 
423 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  31.62 
 
 
438 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.47 
 
 
445 aa  206  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  32.15 
 
 
423 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  32.39 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  32.15 
 
 
423 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  34.12 
 
 
437 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  31.91 
 
 
423 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  32.15 
 
 
423 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  34.12 
 
 
437 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  31.91 
 
 
424 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  31.68 
 
 
424 aa  203  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>