More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1069 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  85.61 
 
 		 419 aa  684    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  85.78 
 
 		 413 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  85.27 
 
 		 416 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  85.85 
 
 		 419 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  87.29 
 
 		 441 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  86.44 
 
 		 427 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  87.25 
 
 		 419 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  87.5 
 
 		 417 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  87.26 
 
 		 417 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 416 aa  819    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  87.44 
 
 		 426 aa  667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  85.85 
 
 		 419 aa  684    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  87.5 
 
 		 417 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  85.82 
 
 		 417 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  85.61 
 
 		 419 aa  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  85.22 
 
 		 416 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  47.57 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  48.88 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  48.17 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  48.17 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  46.65 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  48.17 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  48.52 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  48.52 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  48.03 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  46.96 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  48.28 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  46.96 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  48.01 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  47.89 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  47.65 
 
 		 410 aa  362  6e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  47.3 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  45.17 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  44.05 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  43.06 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  43.06 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.24 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  40.24 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  44.3 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  43.77 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  43.35 
 
 		 437 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  42.41 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  43.16 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  43.09 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  43.09 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  43.24 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  41.91 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  41.18 
 
 		 433 aa  292  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  41.91 
 
 		 436 aa  293  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  41.8 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  43.62 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  42.59 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.29 
 
 		 437 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  42.86 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.86 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.86 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  42.86 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  42.86 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  42.32 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  42.59 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  42.05 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  39.32 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  41.16 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  39.95 
 
 		 434 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  39.95 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  40.19 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  41.64 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.05 
 
 		 409 aa  279  7e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  42.05 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  38.54 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 411 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  40.5 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  40.16 
 
 		 447 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  38.28 
 
 		 445 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  40 
 
 		 423 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  39.53 
 
 		 423 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  39.53 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  39.53 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  39.53 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  39.9 
 
 		 424 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  37.68 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  41.29 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.53 
 
 		 423 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  39.42 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  36.17 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  36.56 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  39.66 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  36.56 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  36.56 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  36.32 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  36.32 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  36.32 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  36.08 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  36.08 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  41.15 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  38.61 
 
 		 440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>