More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4883 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
445 aa  881    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0099  sodium:dicarboxylate symporter  66.67 
 
 
430 aa  556  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  62.03 
 
 
433 aa  504  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  57.49 
 
 
439 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  55.37 
 
 
434 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0216  sodium:dicarboxylate symporter  55.56 
 
 
421 aa  425  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.013646 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  45.37 
 
 
428 aa  333  5e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  42.48 
 
 
444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  42.72 
 
 
444 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  42.72 
 
 
444 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  43.93 
 
 
430 aa  325  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  42.48 
 
 
444 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  42.07 
 
 
432 aa  323  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  41.37 
 
 
433 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  41.25 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.27 
 
 
430 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  40.57 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  40.57 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  40.67 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  40.58 
 
 
449 aa  312  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  41.52 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.56 
 
 
432 aa  301  1e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  44.21 
 
 
417 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  39.51 
 
 
409 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  41.32 
 
 
410 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  40.39 
 
 
402 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  41.87 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  42.63 
 
 
434 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  38.82 
 
 
409 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  42.36 
 
 
434 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  40.47 
 
 
439 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  39.38 
 
 
429 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 
436 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  41.88 
 
 
436 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 
413 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.21 
 
 
440 aa  259  7e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  41.18 
 
 
434 aa  259  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.99 
 
 
437 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40.73 
 
 
437 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  40.89 
 
 
436 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40.26 
 
 
437 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  40.16 
 
 
445 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  38.41 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  35.71 
 
 
423 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  41.6 
 
 
433 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  40.11 
 
 
447 aa  252  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 
442 aa  253  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 
440 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 
440 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  41.44 
 
 
448 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 
440 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  39.68 
 
 
437 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  37.94 
 
 
457 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  38.83 
 
 
416 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.06 
 
 
437 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  38.54 
 
 
427 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  38.37 
 
 
445 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 
441 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  39.06 
 
 
424 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  36.61 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 
457 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  36.1 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  37.59 
 
 
411 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  36.86 
 
 
411 aa  239  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  35.85 
 
 
411 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.85 
 
 
411 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.87 
 
 
411 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  35.85 
 
 
411 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  35.85 
 
 
411 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 
419 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 
419 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  37.8 
 
 
413 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  36.12 
 
 
411 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 
419 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  36.34 
 
 
417 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  41.21 
 
 
438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  37.32 
 
 
416 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  36.6 
 
 
411 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  35.12 
 
 
437 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  38.3 
 
 
452 aa  231  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  36.98 
 
 
441 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  38.11 
 
 
416 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  35.05 
 
 
437 aa  229  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  37.86 
 
 
417 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  39.75 
 
 
437 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 
425 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  38.93 
 
 
436 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  37.86 
 
 
417 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  33.18 
 
 
444 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  37.62 
 
 
417 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  33.18 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  33.65 
 
 
422 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  34.58 
 
 
439 aa  226  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  35.12 
 
 
444 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  33.73 
 
 
423 aa  223  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  32.33 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  37.15 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>