More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0681 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 
409 aa  810    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  42.93 
 
 
409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  46.35 
 
 
410 aa  342  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  40.36 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 
449 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  40.61 
 
 
424 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  40.86 
 
 
440 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  40.86 
 
 
440 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  39.8 
 
 
435 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  39.8 
 
 
443 aa  333  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 
444 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 
444 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 
444 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  40.61 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 
433 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 
444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  44.92 
 
 
417 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  43.03 
 
 
409 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  40.38 
 
 
433 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  43.43 
 
 
402 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  40.71 
 
 
434 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.17 
 
 
411 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  38.93 
 
 
411 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  39.17 
 
 
411 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  39.26 
 
 
413 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  38.93 
 
 
411 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.93 
 
 
411 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  38.93 
 
 
411 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  38.93 
 
 
411 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  39.51 
 
 
411 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  38.69 
 
 
411 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  39.17 
 
 
411 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  41.99 
 
 
447 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  40.58 
 
 
445 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  40.72 
 
 
417 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 
411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 
436 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  39.13 
 
 
434 aa  282  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  39.26 
 
 
436 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  38.98 
 
 
434 aa  280  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 
437 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 
441 aa  279  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  40.73 
 
 
440 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  40.1 
 
 
437 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  40.73 
 
 
440 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  40.73 
 
 
440 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  40.73 
 
 
440 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 
437 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 
437 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  36.59 
 
 
424 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  41.51 
 
 
449 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  40.8 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  40.8 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  41.21 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.75 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  40.8 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  39.42 
 
 
416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 
442 aa  274  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  41.16 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  39.81 
 
 
448 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 
439 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  38.26 
 
 
427 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  40.2 
 
 
413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.52 
 
 
437 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  40.95 
 
 
419 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  40.45 
 
 
417 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  40.45 
 
 
417 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  40.7 
 
 
417 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  40.99 
 
 
441 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  39.51 
 
 
426 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 
416 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  38.72 
 
 
409 aa  259  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.27 
 
 
440 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  39.65 
 
 
437 aa  255  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  35.37 
 
 
457 aa  254  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  35.37 
 
 
457 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  40.88 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  37.41 
 
 
419 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  36.1 
 
 
457 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  38.36 
 
 
419 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  41.37 
 
 
436 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  33.5 
 
 
423 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  33.5 
 
 
423 aa  242  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  33.5 
 
 
423 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  33.5 
 
 
423 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  33.25 
 
 
423 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  33.25 
 
 
423 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
423 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  33.01 
 
 
423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  33.01 
 
 
423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  34.83 
 
 
443 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  35.13 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  36.79 
 
 
417 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  35.13 
 
 
444 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  35.13 
 
 
443 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  35.68 
 
 
409 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  35.64 
 
 
416 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  36.53 
 
 
408 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  35.43 
 
 
409 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  35.64 
 
 
416 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>