More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004292 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  100 
 
 		 424 aa  832    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  85.44 
 
 		 427 aa  666    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  85.61 
 
 		 424 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  57.48 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  59.33 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  60.34 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  59.09 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  59.09 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  60.1 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  60.1 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0671  sodium:dicarboxylate symporter  60.34 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0719  sodium:dicarboxylate symporter  59.85 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3115  sodium:dicarboxylate symporter  57.35 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4004  proton/glutamate symporter, putative  58.44 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  57.31 
 
 		 421 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  58.87 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2949  sodium:dicarboxylate symporter  57.84 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2987  sodium:dicarboxylate symporter  58.1 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0529  sodium:dicarboxylate symporter  61.39 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0598  sodium:dicarboxylate symporter  58.68 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  44.44 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  43.44 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  43.2 
 
 		 436 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  43.72 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  42.58 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  42.3 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  43.75 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  41.75 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  42.34 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  42 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  41.8 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  41.39 
 
 		 440 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  41.39 
 
 		 440 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  42.4 
 
 		 437 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  41.39 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  42.4 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  41.39 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  42.4 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  43.49 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.91 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  42.24 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  41.71 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  43.2 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  41.22 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  41.42 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  41.49 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  39.05 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 452 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  37.96 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  37.96 
 
 		 440 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  37.96 
 
 		 440 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  40.11 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  39.46 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  37.47 
 
 		 424 aa  269  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  39.27 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  35.87 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 444 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 432 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  37.29 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  37.29 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  39.57 
 
 		 410 aa  262  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.8 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  36.94 
 
 		 440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.94 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  37.43 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  37.67 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  36.83 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  36.34 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  38.35 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.35 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  38.07 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  38.11 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.11 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  38.11 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  38.11 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  38.35 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  36.67 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  38.69 
 
 		 411 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  37.86 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  38.06 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.73 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  35.35 
 
 		 402 aa  222  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  33.72 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  34.06 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  34.06 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  34.06 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  34.9 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  34.06 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  34.06 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  34.06 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  33.82 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  33.82 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  34.49 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  35.75 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  34.41 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  33.82 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  34.65 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  35.77 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>