More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0719 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  84.49 
 
 		 424 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  85.92 
 
 		 421 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0719  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 418 aa  812    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3115  sodium:dicarboxylate symporter  82.01 
 
 		 437 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4004  proton/glutamate symporter, putative  82.27 
 
 		 408 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0671  sodium:dicarboxylate symporter  82.37 
 
 		 414 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  81.27 
 
 		 416 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  81.51 
 
 		 416 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  82.35 
 
 		 414 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  81.16 
 
 		 414 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  81.16 
 
 		 414 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  81.4 
 
 		 414 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  81.02 
 
 		 416 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2987  sodium:dicarboxylate symporter  79.47 
 
 		 417 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0529  sodium:dicarboxylate symporter  80.39 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0598  sodium:dicarboxylate symporter  80 
 
 		 392 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2949  sodium:dicarboxylate symporter  65.6 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  61.61 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  58.77 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  61.18 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  42.22 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  41.44 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  40.2 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 440 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 		 437 aa  305  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  41.4 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  39.02 
 
 		 447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.65 
 
 		 437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  39.65 
 
 		 440 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  40.69 
 
 		 439 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  41.28 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  39.65 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.15 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  40.19 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  40.64 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  38.68 
 
 		 449 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  39.9 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  41.13 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  40.86 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  38.81 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 		 438 aa  279  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  38.28 
 
 		 457 aa  269  8e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  37.03 
 
 		 448 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  39.89 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  37.81 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.19 
 
 		 440 aa  246  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  35.94 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  35.94 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  35.84 
 
 		 444 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  36.58 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.29 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  35.9 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  32.51 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  34.85 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  37.97 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  32.51 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  33.66 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  32.51 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  32.51 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  35.84 
 
 		 411 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  35.03 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  33.17 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.84 
 
 		 411 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  34.33 
 
 		 410 aa  229  8e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  35.84 
 
 		 411 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.59 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  36.16 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  35.25 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.25 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  35.25 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  35.25 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.35 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  35.11 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.99 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  33.99 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.43 
 
 		 409 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  35.24 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  36.77 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  33.6 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  34.14 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  33.87 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  33.87 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  33.87 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  33.86 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  33.6 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  33.6 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  35.93 
 
 		 422 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  32.69 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  33.86 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  31.36 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  35.77 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  31.93 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  32.8 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  33.07 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  31.7 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>