More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6252 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  95.02 
 
 		 442 aa  817    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  95.48 
 
 		 442 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 442 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  95.48 
 
 		 442 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  61.41 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  61.41 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  60.33 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  60.98 
 
 		 437 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  60.98 
 
 		 437 aa  544  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  61.27 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  60.98 
 
 		 437 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  60.98 
 
 		 437 aa  544  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  61.21 
 
 		 438 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  60.98 
 
 		 437 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  60.98 
 
 		 437 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  61.45 
 
 		 438 aa  548  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  60.98 
 
 		 437 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  60.98 
 
 		 437 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  60.98 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  60.56 
 
 		 443 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  60.75 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  60.75 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  60.75 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  60.75 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  60.75 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  61.85 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  61.18 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  61.5 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  62.35 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  61.27 
 
 		 438 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  61.27 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  61.27 
 
 		 438 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  59.62 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  61.74 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  61.27 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  61.5 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  57.18 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  57.31 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  56.71 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  56.94 
 
 		 423 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  56.47 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  56.71 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  57.08 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  56.47 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  57.31 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  56.71 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  56.45 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  52.36 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  50.47 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  52.36 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  52.36 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  51.65 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  52.12 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  51.89 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  52.36 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  51.65 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  51.89 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2242  Sodium:dicarboxylate symporter  53.92 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  51.89 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  52.66 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  48.94 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  52.12 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  46.26 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2455  sodium:dicarboxylate symporter  49.62 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2408  sodium:dicarboxylate symporter  49.62 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.557751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.44 
 
 		 421 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.73 
 
 		 420 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.86 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.48 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.48 
 
 		 420 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.01 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.24 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.48 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.96 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  41.2 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  41.03 
 
 		 460 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  40.72 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.19 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  41.09 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.34 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.11 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.24 
 
 		 420 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.24 
 
 		 420 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.11 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  40 
 
 		 440 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  39 
 
 		 438 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.11 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.12 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.88 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.23 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1457  sodium:dicarboxylate symporter  40.76 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  39.81 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.72 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.7 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.02 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.72 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.72 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>