More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4167 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4167  sodium/dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 		 721 aa  1457    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1239  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 736 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3001  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 725 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.620966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3583  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 738 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3757  extracellular solute-binding protein  33.29 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00680272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3213  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2113  extracellular solute-binding protein family 3  30.79 
 
 		 764 aa  330  4e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12331  DAACS family glutamate/aspartate/dicarboxylate symporter  30.67 
 
 		 737 aa  326  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  26.65 
 
 		 417 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  27.32 
 
 		 412 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 		 416 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 		 409 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.04 
 
 		 409 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.04 
 
 		 409 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  25.71 
 
 		 408 aa  97.8  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  27.35 
 
 		 408 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  24.36 
 
 		 419 aa  94.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  26.5 
 
 		 416 aa  94.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  28.26 
 
 		 443 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  24.36 
 
 		 419 aa  93.2  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2740  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.94 
 
 		 452 aa  92.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0765011  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  27.97 
 
 		 443 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  29.19 
 
 		 443 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  28.17 
 
 		 408 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  26.04 
 
 		 420 aa  88.2  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2461  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.71 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3460  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.71 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3423  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.71 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3458  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.71 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0379  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.71 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  30.94 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  24.36 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 266 aa  85.9  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0462  sodium:dicarboxylate symporter  26.55 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  25.17 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  26.85 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  27.47 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4433  C4-dicarboxylate transporter DctA  27.3 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  26.91 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  25.14 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 268 aa  83.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3388  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.16 
 
 		 441 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4205  C4-dicarboxylate transport protein  24.93 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2297  sodium:dicarboxylate symporter  24.86 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372192  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  26.4 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  26.85 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  26.85 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4551  sodium:dicarboxylate symporter  26.72 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4639  sodium:dicarboxylate symporter  26.72 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  24.79 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  23.86 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  22.99 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4063  C4-dicarboxylate transport protein  25.98 
 
 		 435 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3732  C4-dicarboxylate transporter DctA  25.39 
 
 		 440 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  27.61 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 273 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0568  C4-dicarboxylate transporter DctA  25.69 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  27.3 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01460  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.93 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  26.99 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  25.08 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4934  sodium:dicarboxylate symporter  26.23 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0163  C4-dicarboxylate transporter DctA  25.91 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0646  C4-dicarboxylate transporter DctA  25.91 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0613  C4-dicarboxylate transporter DctA  25.91 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  27.3 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.28 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  24.79 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  27.59 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  25.46 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  24.63 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0194  C4-dicarboxylate transporter DctA  25.21 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2035  sodium:dicarboxylate symporter  24.71 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.39 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  26.69 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  22.44 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  24.11 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  27.3 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  24.73 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  24.69 
 
 		 270 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2234  sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1203  C4-dicarboxylate transporter DctA  25.3 
 
 		 440 aa  77  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0237  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.58 
 
 		 447 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0515  sodium:dicarboxylate symporter  25.44 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2773  Sodium:dicarboxylate symporter  24.93 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1244  sodium:dicarboxylate symporter  24.4 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  23.48 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3595  sodium:dicarboxylate symporter  25.22 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  28.06 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  23.3 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  26.15 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  23.43 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4878  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.93 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  26.39 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  25.78 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  23.43 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>