More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4433 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4433  C4-dicarboxylate transporter DctA  100 
 
 		 438 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3956  C4-dicarboxylate transporter DctA  90.87 
 
 		 438 aa  744    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4324  C4-dicarboxylate transporter DctA  91.1 
 
 		 438 aa  748    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5335  C4-dicarboxylate transporter DctA  73.83 
 
 		 443 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3948  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.83 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3012  C4-dicarboxylate transporter DctA  67.22 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.723105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1420  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.3 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0554  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.56 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1101  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.55 
 
 		 425 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2740  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.98 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0765011  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0237  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.7 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4368  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.38 
 
 		 441 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3444  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.33 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3279  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.38 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3146  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.18 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3732  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.94 
 
 		 440 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3458  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.16 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2461  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.16 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3460  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.16 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3423  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.16 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0379  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.16 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0796  C4-dicarboxylate transporter DctA  68.92 
 
 		 437 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.86356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0613  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.98 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0163  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.98 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0646  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.98 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0307  C4-dicarboxylate transporter DctA  68.27 
 
 		 444 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3275  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.86 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.292333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3473  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.95 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0568  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.16 
 
 		 440 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3388  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.4 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3085  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.55 
 
 		 440 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0541  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.22 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0567  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.22 
 
 		 440 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245555  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01460  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.8 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0194  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.49 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2596  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.95 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1203  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.92 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4878  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.1 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2255  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.04 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16569  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3483  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.04 
 
 		 436 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.225944  normal  0.530275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1886  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.8 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1729  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.04 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2714  sodium:dicarboxylate symporter  59.62 
 
 		 455 aa  455  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.76 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.42 
 
 		 454 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.66 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.67 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  49.76 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.34 
 
 		 465 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.12 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.77 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  53.61 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  53.61 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.07 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.71 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  53.61 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  49.16 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.42 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.65 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.42 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.31 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  47.36 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.48 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.29 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.3 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.06 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.3 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  49.41 
 
 		 449 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  48.83 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.46 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.12 
 
 		 452 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.58 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3060  sodium:dicarboxylate symporter  49.07 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694529  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  46.92 
 
 		 444 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.05 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.29 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  49.4 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.29 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.07 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.24 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.05 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.05 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  47.24 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.18 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  48.2 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  47.75 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.05 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.05 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  48.1 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  48.1 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.51 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.7 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.39 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  48.57 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.01 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  50.6 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>