More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0237 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3948  C4-dicarboxylate transporter DctA  88.1 
 
 		 442 aa  727    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0237  C4-dicarboxylate transporter DctA  100 
 
 		 447 aa  876    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1420  C4-dicarboxylate transporter DctA  82.29 
 
 		 443 aa  693    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1101  C4-dicarboxylate transporter DctA  81.58 
 
 		 425 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0307  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.2 
 
 		 444 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0796  C4-dicarboxylate transporter DctA  81.82 
 
 		 437 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.86356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3444  C4-dicarboxylate transporter DctA  73.56 
 
 		 467 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4368  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.79 
 
 		 441 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3279  C4-dicarboxylate transporter DctA  72.66 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3146  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.74 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0554  C4-dicarboxylate transporter DctA  71.05 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3275  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.97 
 
 		 446 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.292333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3473  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.52 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2740  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.27 
 
 		 452 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0765011  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0613  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.93 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3085  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.56 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0568  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.33 
 
 		 440 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0163  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.93 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0646  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.93 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3732  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.75 
 
 		 440 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4433  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.7 
 
 		 438 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3012  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.89 
 
 		 436 aa  538  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.723105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3388  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.92 
 
 		 441 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001363 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2461  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.36 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3460  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.36 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3423  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.36 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0541  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.43 
 
 		 440 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0567  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.43 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245555  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0379  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.36 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3458  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.36 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5335  C4-dicarboxylate transporter DctA  67.15 
 
 		 443 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3956  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.67 
 
 		 438 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4324  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.43 
 
 		 438 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01460  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.78 
 
 		 449 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0194  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.2 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2596  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.03 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4878  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.33 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1203  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.35 
 
 		 440 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2255  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.59 
 
 		 436 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16569  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1886  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.09 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3483  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.37 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.225944  normal  0.530275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1729  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.09 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  54.02 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.37 
 
 		 448 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  54.46 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.14 
 
 		 465 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  54.92 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  51.99 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.72 
 
 		 451 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  54.23 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  51.05 
 
 		 439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.32 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.06 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  51.3 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.52 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.48 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.82 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.72 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.03 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.06 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.56 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.52 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.42 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.99 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.95 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  50.9 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.18 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.17 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.18 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.77 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.42 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  52.42 
 
 		 442 aa  428  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2714  sodium:dicarboxylate symporter  56.63 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.18 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  50.6 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.28 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  50.67 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.23 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.4 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.81 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.14 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.4 
 
 		 440 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.71 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  50.67 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  49.77 
 
 		 454 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  48.71 
 
 		 446 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.8 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  49.64 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  50.61 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.99 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.29 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.76 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>