More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2100 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  98.86 
 
 
440 aa  851    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  100 
 
 
440 aa  861    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  98.86 
 
 
440 aa  851    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  62.9 
 
 
437 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  61.54 
 
 
428 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.54 
 
 
428 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.54 
 
 
428 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  63.39 
 
 
442 aa  534  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.54 
 
 
428 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.54 
 
 
428 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.54 
 
 
428 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.36 
 
 
448 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  61.3 
 
 
428 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.05 
 
 
465 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.3 
 
 
428 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  61.3 
 
 
428 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.35 
 
 
447 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  59.12 
 
 
439 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.37 
 
 
430 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.81 
 
 
436 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  60.27 
 
 
453 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  58.2 
 
 
439 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.9 
 
 
429 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.81 
 
 
436 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.39 
 
 
428 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  59.02 
 
 
460 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.45 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.94 
 
 
451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.94 
 
 
452 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.11 
 
 
430 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.06 
 
 
452 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.94 
 
 
439 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.19 
 
 
429 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.19 
 
 
429 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.41 
 
 
430 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.82 
 
 
429 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  57.98 
 
 
444 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.99 
 
 
442 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.19 
 
 
429 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.11 
 
 
428 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.06 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.06 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.06 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  60.14 
 
 
447 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.06 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.06 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  58.7 
 
 
454 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.78 
 
 
449 aa  502  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 
429 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.43 
 
 
430 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.24 
 
 
444 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.83 
 
 
448 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  57.98 
 
 
447 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.2 
 
 
430 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.14 
 
 
429 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.2 
 
 
430 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.81 
 
 
442 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.43 
 
 
429 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.52 
 
 
428 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 
428 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.67 
 
 
431 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.14 
 
 
429 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.52 
 
 
444 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3554  sodium:dicarboxylate symporter  57.97 
 
 
455 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.18 
 
 
447 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.2 
 
 
429 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.22 
 
 
454 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 
429 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  57.61 
 
 
446 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  58.31 
 
 
449 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.52 
 
 
428 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.28 
 
 
428 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  56.88 
 
 
449 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.47 
 
 
447 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.28 
 
 
428 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  57.75 
 
 
447 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.28 
 
 
428 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.28 
 
 
428 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0518  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.05 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51947  normal  0.633866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.24 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5393  sodium:dicarboxylate symporter  57.41 
 
 
455 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.48 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.01 
 
 
440 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1872  C4-dicarboxylate transporter  61.83 
 
 
430 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.28 
 
 
444 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  56.64 
 
 
447 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3356  Sodium/dicarboxylate symporter  57.41 
 
 
457 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60762  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.78 
 
 
440 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.91 
 
 
440 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  58.78 
 
 
466 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.32 
 
 
426 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.71 
 
 
444 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.45 
 
 
420 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.69 
 
 
438 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.69 
 
 
420 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31210  C4-dicarboxylate transport protein  57.51 
 
 
441 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.93 
 
 
420 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.69 
 
 
420 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  58.19 
 
 
455 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  57.08 
 
 
448 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>