More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0192 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.66 
 
 		 428 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  94.17 
 
 		 428 aa  785    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  79.28 
 
 		 429 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  100 
 
 		 429 aa  854    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.66 
 
 		 428 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  77.67 
 
 		 431 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.07 
 
 		 430 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.66 
 
 		 444 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.9 
 
 		 428 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.8 
 
 		 429 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.9 
 
 		 444 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  77.91 
 
 		 429 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.9 
 
 		 428 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.07 
 
 		 430 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  79.28 
 
 		 429 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.07 
 
 		 430 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  99.07 
 
 		 429 aa  847    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.66 
 
 		 428 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  79.28 
 
 		 429 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  78.66 
 
 		 428 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0518  C4-dicarboxylate transporter DctA  76.98 
 
 		 426 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51947  normal  0.633866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  75.42 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4197  C4-dicarboxylate transporter DctA  76.74 
 
 		 426 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  67.21 
 
 		 437 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  66.75 
 
 		 453 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  64.35 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.97 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.48 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  64.55 
 
 		 439 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  65.48 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2729  sodium:dicarboxylate symporter  65.63 
 
 		 461 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.16 
 
 		 465 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.79 
 
 		 454 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1457  sodium:dicarboxylate symporter  64.65 
 
 		 438 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.32 
 
 		 436 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  63.86 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.92 
 
 		 444 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.49 
 
 		 451 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  63.61 
 
 		 449 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.85 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.08 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  64.78 
 
 		 449 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.18 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.21 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  62.53 
 
 		 446 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  62 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  62.23 
 
 		 447 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  66.19 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.57 
 
 		 447 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  62.65 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.38 
 
 		 452 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09460  C4-dicarboxylate transport protein  65.07 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.81039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  62.26 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.81 
 
 		 439 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  64.69 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  60.24 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.14 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  61.37 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  62.32 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  60.14 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  64.78 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  60.56 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  62.32 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.97 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4205  C4-dicarboxylate transport protein  64.07 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.81 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2234  sodium:dicarboxylate symporter  63.81 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  62 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  59.73 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.61 
 
 		 430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  58.96 
 
 		 440 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  59.2 
 
 		 440 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.33 
 
 		 452 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  58.96 
 
 		 440 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.75 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.45 
 
 		 429 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.77 
 
 		 430 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.67 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.45 
 
 		 429 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.45 
 
 		 429 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  59.95 
 
 		 455 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.21 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  61 
 
 		 460 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  59.9 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3060  sodium:dicarboxylate symporter  60.96 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.68 
 
 		 447 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  59.86 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  62.11 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  58.65 
 
 		 450 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.84 
 
 		 440 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.84 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.32 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  61.93 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>