More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3213 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3757  extracellular solute-binding protein  82.13 
 
 		 722 aa  1196    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00680272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3213  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 722 aa  1471    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3583  extracellular solute-binding protein  81.86 
 
 		 738 aa  1227    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3001  extracellular solute-binding protein  80.75 
 
 		 725 aa  1218    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.620966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1239  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 736 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4167  sodium/dicarboxylate symporter family protein  32.22 
 
 		 721 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2113  extracellular solute-binding protein family 3  29.61 
 
 		 764 aa  361  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12331  DAACS family glutamate/aspartate/dicarboxylate symporter  26.16 
 
 		 737 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  26.74 
 
 		 412 aa  94  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 416 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  26.39 
 
 		 409 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 416 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 416 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.43 
 
 		 409 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 416 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  26.04 
 
 		 409 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  27.82 
 
 		 416 aa  87.8  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  25 
 
 		 408 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  26.47 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  26.55 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.99 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.86 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.38 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  27.92 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  26.5 
 
 		 266 aa  77  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  25.35 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  23.4 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  23.4 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  27.04 
 
 		 417 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  23.4 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  23.4 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  24.43 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.53 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  24 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  24.43 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  24.43 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  25.09 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.27 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  26.25 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  24.73 
 
 		 435 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  24.73 
 
 		 435 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 		 273 aa  73.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  26.15 
 
 		 430 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  24.49 
 
 		 278 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 266 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.95 
 
 		 256 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  22.82 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25.84 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  23.66 
 
 		 424 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  23.77 
 
 		 266 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  26.75 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0515  sodium:dicarboxylate symporter  24.05 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  24.73 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  23.59 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  25.57 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.5 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  25.09 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  25.85 
 
 		 272 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  23.81 
 
 		 440 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  24.26 
 
 		 420 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  25.28 
 
 		 443 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  23.81 
 
 		 440 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 272 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  25.17 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  23.81 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  25.47 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  22.32 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  23.81 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  24.64 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  23.26 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.66 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  23.79 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  23.9 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  22.02 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  24.58 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  24.7 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  22.89 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  23.85 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  23.45 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  25.19 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  23.35 
 
 		 443 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  28.05 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  23.79 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  25.75 
 
 		 409 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  23.91 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.67 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  38.64 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>