More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1239 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1239  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 736 aa  1491    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3001  extracellular solute-binding protein  40.03 
 
 		 725 aa  555  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.620966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3583  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 		 738 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3757  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 		 722 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00680272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3213  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 722 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4167  sodium/dicarboxylate symporter family protein  33.06 
 
 		 721 aa  442  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2113  extracellular solute-binding protein family 3  31.11 
 
 		 764 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12331  DAACS family glutamate/aspartate/dicarboxylate symporter  26.86 
 
 		 737 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 250 aa  90.9  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  24.79 
 
 		 272 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 276 aa  86.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.21 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  27.81 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  21.96 
 
 		 278 aa  77  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  23.23 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  26.67 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  21.72 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  23.23 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.17 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  29.47 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  23.91 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  29 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  25.66 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  25.94 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.78 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  23.78 
 
 		 436 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 270 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.83 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  29.29 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 258 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  25.36 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  24.5 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.83 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  23.81 
 
 		 412 aa  72  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  25.94 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5419  extracellular solute-binding protein family 3  27.49 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  29.3 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  29.3 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  29.3 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  27.74 
 
 		 439 aa  72  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  25.24 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  27.85 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.59 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  26.63 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.78 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  23.08 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  26.11 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  25.07 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  26.28 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  25.07 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  36.78 
 
 		 320 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 273 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  24.5 
 
 		 442 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 		 408 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  26.2 
 
 		 480 aa  70.5  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  23.78 
 
 		 440 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  22.84 
 
 		 288 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  25.07 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  29.59 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  24.14 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  37.37 
 
 		 272 aa  70.1  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  24.18 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  22.82 
 
 		 437 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  23.95 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  23.55 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  25.32 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  23.51 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  25.16 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  22.48 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  23.43 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  23.43 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  22.27 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 247 aa  68.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  24.5 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  25.4 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  25.16 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1983  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  28.29 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  26.03 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  22.71 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  25.17 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  23.11 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  22.71 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  22.71 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5123  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.12567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  24.85 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  25.44 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  24.85 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  23.11 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  22.71 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  23.81 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  23.7 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>