More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1983 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1983  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5419  extracellular solute-binding protein family 3  64.84 
 
 		 275 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240079 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5123  extracellular solute-binding protein family 3  64.84 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.12567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5552  ABC transporter substrate binding protein (glutamine)  67.07 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5882  extracellular solute-binding protein  62.74 
 
 		 278 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6047  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.46 
 
 		 598 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166994  normal  0.759317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.68 
 
 		 598 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6340  extracellular solute-binding protein family 3  38.02 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.646193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2482  extracellular solute-binding protein family 3  35.06 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000146817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 		 591 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5383  amino acid ABC transporter permease  40.48 
 
 		 591 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5472  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 		 591 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693793  normal  0.393619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3866  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 		 582 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  31.27 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  29.45 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33.95 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.2 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  32.88 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.04 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.76 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 255 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.78 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2542  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.96 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.579681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2584  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.96 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2496  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.96 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2705  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.96 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2596  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.96 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.11 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  30.28 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  29.46 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1346  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1342  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.232393  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  30.16 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.48 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02195  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.46 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3018  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.54 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3134  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2604  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.46 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0747  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1095  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.54 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1579  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.54 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.54 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.63 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02234  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2465  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1343  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.908604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2603  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.11 
 
 		 324 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2687  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2459  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02194  hypothetical protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3449  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.45 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  30.8 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.8 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  28.51 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  31.98 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  30.36 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.11 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.24 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2466  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  29.57 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2568  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 258 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>