More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3383 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 320 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  40.46 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  41.76 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  40.32 
 
 		 583 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  35.31 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  35.23 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 		 604 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  36.29 
 
 		 604 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  38.21 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  35.91 
 
 		 604 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  38.52 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  37.45 
 
 		 586 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  36.64 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  35 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  38.78 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  36.9 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  35.5 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  35.69 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  33.6 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  32.66 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.98 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.67 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  31.33 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  32.06 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  28.85 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  32.92 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.4 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.47 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  31.14 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  30.62 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  32.32 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  28.75 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.41 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 277 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 		 513 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  30.55 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 269 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 237 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 260 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  30.55 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  27 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 250 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 249 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.67 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.45 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  29.05 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  29.61 
 
 		 254 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.34 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  30.84 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.33 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  30.65 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 275 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.87 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.66 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.71 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.9 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  29.28 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 272 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  25.65 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>