More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1316 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  36.95 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.98 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  35.32 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.15 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  30.92 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  29.6 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  32.94 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  29.58 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.53 
 
 		 329 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  31.98 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  29.71 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  31.82 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  32.24 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  29.56 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  29.75 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  31.1 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.27 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  29.07 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 264 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.52 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 222 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.23 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.29 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 604 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  28.25 
 
 		 604 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  28.25 
 
 		 604 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.91 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.61 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  26.98 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.91 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.91 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.91 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  26.72 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.35 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.22 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.22 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  29.24 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  26.22 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  26.86 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  24.28 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  25.4 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.66 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  25.29 
 
 		 586 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.97 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.97 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.97 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.97 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.13 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  28.75 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.48 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0293  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  24.19 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  25.32 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.58 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  27.36 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.58 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.75 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>