More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5128 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  84.84 
 
 		 310 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  75.97 
 
 		 329 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  32.32 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  31.25 
 
 		 273 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  30.83 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  34.87 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  31.02 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  32.92 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  33.74 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  33.91 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.58 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  29.81 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 		 251 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.17 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  30.9 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.62 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  29.19 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 275 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  27.34 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 281 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.19 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.49 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.19 
 
 		 248 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.19 
 
 		 248 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.19 
 
 		 248 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.19 
 
 		 248 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  26.18 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 284 aa  85.9  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  26.25 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.76 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  26.25 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  30.74 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.34 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.19 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  26.19 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4864  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.54 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.86 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>