More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3686 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  43.54 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  44.22 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  43.02 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  39.4 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  46.29 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  39.15 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  41.98 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  41.54 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  36.78 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  39.26 
 
 		 604 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  39.26 
 
 		 604 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  39.26 
 
 		 604 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  34.68 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  34.75 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  34.98 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  38.98 
 
 		 583 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  36.86 
 
 		 586 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  36.88 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  33.09 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.32 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  30.67 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  30.45 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  29.76 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  28.43 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  26.91 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  29.79 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.53 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  27.5 
 
 		 273 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  31.98 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 281 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1098  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.041078  normal  0.0345837 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13990  putative amino acid ABC transporter  31.38 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258104  normal  0.0183711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 258 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.52 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  27.4 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 237 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 257 aa  92.8  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 260 aa  92.8  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.89 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  28.96 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.87 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0700  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  29.39 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.347684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.82 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.63 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.82 
 
 		 248 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  26.82 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.82 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.87 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  25.43 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.26 
 
 		 363 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.82 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3018  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.44 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0747  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.44 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1579  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.44 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.44 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1095  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  29.44 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 268 aa  89.7  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  25.96 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.93 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1240  amino acid binding protein  30.13 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.86 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.42 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0886  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533017 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  26.6 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>