More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0107 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 313 aa  634    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  70.57 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  70.57 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  70.57 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  70.57 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  70.57 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  70.57 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  70.57 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  72.5 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  69.96 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  69.96 
 
 		 317 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  67.33 
 
 		 317 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  67 
 
 		 317 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  70.36 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  68.57 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.82 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  69.79 
 
 		 314 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  65.36 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  65.6 
 
 		 313 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  65.6 
 
 		 313 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  65.6 
 
 		 313 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  63.88 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  61.13 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  60.78 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.16 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  59.79 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.16 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  58.16 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.16 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.16 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  58.16 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  58.16 
 
 		 406 aa  341  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  56.94 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  56.09 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  56.09 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  56.09 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  58.93 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.06 
 
 		 314 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  58.21 
 
 		 313 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  57.19 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  59.43 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  52.53 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  53.93 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  53.78 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  48.84 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  49.35 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.04 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  56.78 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  50.89 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  51.25 
 
 		 327 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  51.29 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  50.71 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  51.48 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  47.47 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  49.3 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  47.54 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  47.5 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  43.52 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  44.88 
 
 		 341 aa  232  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  45.19 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  40.66 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  39.41 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  40.16 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  39.79 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  41.18 
 
 		 734 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  32.27 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  31.86 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  31.69 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.65 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.9 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.9 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.9 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.73 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.47 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.47 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.47 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.47 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  32.03 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.03 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.6 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.6 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.6 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.6 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  31.97 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  31.52 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.18 
 
 		 264 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.76 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.76 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  31.17 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>