More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4349 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  84.49 
 
 
311 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  62.07 
 
 
311 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  60.78 
 
 
312 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  61.92 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  61.43 
 
 
313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  61.43 
 
 
313 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  61.21 
 
 
310 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  61.21 
 
 
310 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  61.21 
 
 
310 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.49 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.49 
 
 
311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.49 
 
 
311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  60.49 
 
 
311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.49 
 
 
311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  60.49 
 
 
311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  60.49 
 
 
406 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.51 
 
 
314 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  58.78 
 
 
312 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.58 
 
 
313 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  57.3 
 
 
328 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  57.3 
 
 
328 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  57.3 
 
 
328 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.3 
 
 
328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.3 
 
 
328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.3 
 
 
328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.3 
 
 
328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  56.03 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  55.67 
 
 
317 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  56.23 
 
 
313 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  56.23 
 
 
313 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  56.23 
 
 
313 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  55.56 
 
 
314 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  54.64 
 
 
315 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 
317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  53.74 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  53.38 
 
 
317 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  56.14 
 
 
326 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  55 
 
 
347 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.78 
 
 
313 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  56.06 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  56.03 
 
 
314 aa  311  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 
309 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  54.49 
 
 
313 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.93 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  53.38 
 
 
326 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  53.26 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  51.54 
 
 
326 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  51.24 
 
 
315 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  46.58 
 
 
315 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  47.37 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  46.41 
 
 
301 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  48.93 
 
 
311 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  48.41 
 
 
308 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  49.11 
 
 
311 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  48.52 
 
 
305 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  46.37 
 
 
295 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  44.95 
 
 
335 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  43.82 
 
 
341 aa  225  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  42.55 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 
332 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  42.55 
 
 
339 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  42.2 
 
 
348 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  41 
 
 
734 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  36.79 
 
 
331 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  37.84 
 
 
337 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  32.27 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 
302 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  29.43 
 
 
313 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
296 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  31.07 
 
 
320 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  26.62 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.39 
 
 
313 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.06 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  30.13 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  29.36 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.81 
 
 
266 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.81 
 
 
266 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  27.93 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.81 
 
 
266 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  27.93 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.93 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 
296 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.93 
 
 
264 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.57 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.09 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.21 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.21 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.06 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.29 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  27.86 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.06 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.79 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>