More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3708 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
354 aa  714    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  86.49 
 
 
734 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  51.46 
 
 
348 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  46.96 
 
 
326 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  47.16 
 
 
335 aa  262  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  47.41 
 
 
326 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  47.81 
 
 
332 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  48.54 
 
 
341 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.12 
 
 
309 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  46.81 
 
 
309 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 
309 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  40.69 
 
 
311 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.64 
 
 
313 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  42.7 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 
310 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  42.7 
 
 
311 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.7 
 
 
311 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
314 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  40.22 
 
 
339 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  44.15 
 
 
315 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  43.4 
 
 
315 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  44.53 
 
 
326 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  40.13 
 
 
313 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 
317 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 
313 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 
317 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  43.77 
 
 
327 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 
317 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  42.64 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.83 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.34 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  39.78 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  39.78 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.91 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.91 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.91 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.66 
 
 
313 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 
313 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.91 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.91 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.91 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 
347 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.91 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  40.91 
 
 
305 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  42.28 
 
 
308 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  39.05 
 
 
314 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  40.82 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  40.98 
 
 
312 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  41.2 
 
 
311 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.13 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.13 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.13 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.13 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.13 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.13 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.13 
 
 
406 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  38.68 
 
 
324 aa  182  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  38.12 
 
 
331 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  42.39 
 
 
295 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  37.35 
 
 
337 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  30.38 
 
 
323 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  30.59 
 
 
312 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  28.66 
 
 
313 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
302 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
304 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 
302 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.8 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  31.54 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
312 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
281 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 
301 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  27.06 
 
 
296 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  27.45 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  26.95 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  25.7 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  24.4 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  24.81 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.51 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  26.19 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
265 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.46 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>