More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4187 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
312 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  90.29 
 
 
310 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  90.29 
 
 
310 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  90.29 
 
 
310 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  87.7 
 
 
311 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  88.18 
 
 
313 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  88.78 
 
 
313 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  79.64 
 
 
311 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  79.64 
 
 
397 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  79.64 
 
 
311 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  79.64 
 
 
311 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  79.64 
 
 
406 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  79.29 
 
 
311 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  79.64 
 
 
311 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  64.17 
 
 
314 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  59.12 
 
 
309 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  59.09 
 
 
311 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  60.14 
 
 
313 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  60.85 
 
 
311 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  60.28 
 
 
317 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  61.29 
 
 
317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  60.93 
 
 
317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  60.28 
 
 
317 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  60.57 
 
 
317 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  59.5 
 
 
312 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  59.5 
 
 
315 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  61.79 
 
 
347 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.72 
 
 
313 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  58.36 
 
 
328 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  58.36 
 
 
328 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  58.36 
 
 
328 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.36 
 
 
328 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.36 
 
 
328 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.36 
 
 
328 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.36 
 
 
328 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  57.71 
 
 
313 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  57.71 
 
 
313 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  57.35 
 
 
313 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  55.56 
 
 
314 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  53.85 
 
 
313 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  54.48 
 
 
314 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  54.86 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  50.53 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  50.18 
 
 
327 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  48.38 
 
 
309 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.34 
 
 
309 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  48.49 
 
 
326 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  46.55 
 
 
301 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 
326 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  49.1 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  45.6 
 
 
305 aa  258  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  50.2 
 
 
315 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  47.97 
 
 
315 aa  254  9e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  47.48 
 
 
311 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  51.21 
 
 
310 aa  252  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  45.33 
 
 
335 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  44.88 
 
 
295 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  42.14 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 
332 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  41.64 
 
 
339 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  40.38 
 
 
354 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  38.96 
 
 
348 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  41.13 
 
 
734 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  37.31 
 
 
337 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  36.75 
 
 
331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  32.73 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 
323 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  26.61 
 
 
313 aa  87  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.46 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  27.45 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.64 
 
 
313 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  26.79 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  29.53 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  26.02 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.85 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.72 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.72 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.72 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.78 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  26.78 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.72 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.78 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.11 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.72 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.72 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>