More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0235 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  95.69 
 
 
255 aa  493  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  84.77 
 
 
256 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  82.42 
 
 
256 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.23 
 
 
260 aa  345  5e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  68.64 
 
 
257 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  64.2 
 
 
257 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  67.8 
 
 
257 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  66.67 
 
 
257 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  66.53 
 
 
257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  60.62 
 
 
260 aa  325  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.26 
 
 
257 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.26 
 
 
257 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  63.08 
 
 
260 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  64.26 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  63.83 
 
 
260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  63.83 
 
 
260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  63.09 
 
 
261 aa  316  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  61.54 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  60.77 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  52.17 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  48.12 
 
 
265 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.37 
 
 
265 aa  241  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.37 
 
 
265 aa  241  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.37 
 
 
265 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  46.99 
 
 
265 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  46.99 
 
 
265 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.99 
 
 
265 aa  241  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.99 
 
 
265 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.37 
 
 
265 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  50.89 
 
 
250 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  46 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  45.53 
 
 
259 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  45.53 
 
 
259 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  49.14 
 
 
273 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.19 
 
 
262 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  48.1 
 
 
281 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  46.18 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  47.75 
 
 
268 aa  221  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  45.35 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  46.41 
 
 
489 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
489 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
489 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  46.72 
 
 
278 aa  215  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  45.58 
 
 
271 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  40.56 
 
 
259 aa  211  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.61 
 
 
503 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.04 
 
 
503 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  41.02 
 
 
252 aa  193  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 
483 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.62 
 
 
266 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.08 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 
266 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 
266 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 
266 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 
253 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  42.39 
 
 
266 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  40.7 
 
 
264 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
270 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40 
 
 
266 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.79 
 
 
264 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  40.34 
 
 
266 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 
266 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 
264 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 
264 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  39 
 
 
270 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  38.02 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.76 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  39.37 
 
 
265 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 
284 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.15 
 
 
266 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  36.09 
 
 
264 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  39.75 
 
 
266 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  39.75 
 
 
315 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  39.75 
 
 
320 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  36.12 
 
 
265 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  37.15 
 
 
266 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  36.78 
 
 
266 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  36.78 
 
 
266 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  36.78 
 
 
266 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  36.97 
 
 
264 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  36.76 
 
 
266 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  37.21 
 
 
265 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>