More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1530 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  91 
 
 		 310 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  91 
 
 		 310 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  91 
 
 		 310 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  87.7 
 
 		 312 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  85.35 
 
 		 313 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  85.3 
 
 		 313 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  75.24 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  75.24 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  75.24 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  75.24 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  75.24 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  75.24 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  74.92 
 
 		 311 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  63.23 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  61.92 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.45 
 
 		 313 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  58.03 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  58.78 
 
 		 312 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  59.07 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  58.8 
 
 		 317 aa  334  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  58.8 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  59.29 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  59.29 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  58.93 
 
 		 317 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  56.81 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  56.81 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  56.81 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  57.5 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  56.58 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  56.58 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  56.58 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.58 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.58 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.58 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.58 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  59.43 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.59 
 
 		 313 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  51.61 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  52.49 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  53.4 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.83 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  48.87 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  48.95 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  49.12 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  49.12 
 
 		 326 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  47.2 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  45.93 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  48.89 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  45.05 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  47.12 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  47.2 
 
 		 315 aa  251  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  48.11 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  45.32 
 
 		 295 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  45.02 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  43.62 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  42.7 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  43.51 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  42.17 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  43.78 
 
 		 734 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  37.31 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  37.18 
 
 		 331 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  31.36 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.46 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.02 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  27.13 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.54 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.94 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  25.61 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.52 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.92 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  27.59 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  28.09 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5150  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109685  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.31 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.31 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.12 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.12 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.12 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.12 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.93 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.88 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.88 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>