More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0869 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 269 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  99.63 
 
 		 285 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  98.51 
 
 		 285 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  32.46 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  30.55 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  25.39 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.35 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.35 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.35 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.79 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.96 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.96 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.96 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.96 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.83 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  38.53 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 307 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.74 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.74 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  29.57 
 
 		 586 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.06 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  40 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.32 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  26.47 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.44 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  29.74 
 
 		 583 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.31 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.43 
 
 		 501 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  27.78 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.45 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.45 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.45 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  27.68 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.16 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  28.45 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  28.79 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  27 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.45 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  28.46 
 
 		 604 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 604 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  28.46 
 
 		 604 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.79 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.79 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  31.08 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  27.24 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.08 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.63 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.68 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.68 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.8 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  25.64 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  25.65 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.67 
 
 		 503 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.14 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  44.58 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0945  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.94 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.656461  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.34 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  27.88 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.88 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.88 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  27.78 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4868  extracellular solute-binding protein family 3  27.16 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.468978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  29.79 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>