More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4868 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4868  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.468978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2697  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 517 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.44 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  30.97 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  30.53 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.48 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  31.2 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  29.01 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.44 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.44 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.34 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  29.26 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  29.87 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.19 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  29.28 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.34 
 
 		 251 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 		 256 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  24.73 
 
 		 502 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  24.73 
 
 		 502 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  26.44 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4186  extracellular solute-binding protein family 3  29.32 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.98 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.95 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.71 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.51 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.34 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  24.61 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0217  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  26.52 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  29.85 
 
 		 266 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  28.02 
 
 		 250 aa  89  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29.85 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.32 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28.2 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  25.94 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29.85 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29.85 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.97 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  29.48 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.74 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.32 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.88 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.84 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.84 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.84 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.84 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.84 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>