More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1641 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  35.35 
 
 		 490 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  28.09 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4868  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.468978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  29.72 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.05 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.63 
 
 		 513 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  27.87 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.47 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0600  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.76 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0871722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  27.34 
 
 		 604 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 		 604 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  27.34 
 
 		 604 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  28.23 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 222 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.92 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  26.12 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5146  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  26.72 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.58 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.7 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.58 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  27.65 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  28.07 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.82 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.82 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.82 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.3 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.05 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  36.67 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  28.51 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.3 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.83 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.3 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.23 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.34 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  29.63 
 
 		 501 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.83 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.51 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.51 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.58 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.51 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.97 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.77 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.7 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.7 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  27.72 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.05 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.78 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.79 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.79 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.79 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.02 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.47 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.79 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  27.9 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.05 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  28 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6800  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.02 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.02 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.02 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.48 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  34.68 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.78 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.78 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>