More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3515 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 275 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  62.55 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  55.22 
 
 		 277 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  54.51 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  57.69 
 
 		 237 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  52.19 
 
 		 273 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  52.32 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  47.58 
 
 		 273 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  32.4 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  31.89 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  32.3 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.23 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 		 322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.28 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  32.03 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  27.41 
 
 		 583 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  30.83 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 604 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  28.29 
 
 		 604 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  28.29 
 
 		 604 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 310 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  27.41 
 
 		 586 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  32.5 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  27.02 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  29.32 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.34 
 
 		 304 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.58 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.01 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  27.84 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  29.12 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  27.42 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.2 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.93 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2995  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4899  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.092586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5371  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.91 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.32 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.08 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  28.11 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.74 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  31.13 
 
 		 323 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.62 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 264 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 257 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.47 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.05 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  26.42 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.04 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  26.42 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.04 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.51 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  35.26 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.52 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.06 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.74 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  29.66 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>