More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1379 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  31.34 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  31.75 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  28.79 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.82 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  29.6 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  25.25 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  27.89 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  30.61 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  29.32 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  28.35 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  28.35 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  27.65 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  30.5 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  27.76 
 
 		 583 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.01 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  27.64 
 
 		 586 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 250 aa  85.9  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.09 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  28.07 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  28.06 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4868  extracellular solute-binding protein family 3  27.93 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.468978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  26.07 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.1 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5603  extracellular solute-binding protein family 3  25.1 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0293  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0723  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  28.4 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  29.29 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  24.27 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  26.84 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  25.3 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  25.78 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  26.22 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1330  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  24.82 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2658  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.22 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1147  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0439  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.501254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  25.86 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  24.9 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  26.29 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  26.29 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  28.44 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.61 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0600  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.18 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0871722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  24.24 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  24 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  24.24 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.22 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  29.51 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>