More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0293 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0293  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  51.17 
 
 		 296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5150  extracellular solute-binding protein  52.17 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109685  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5146  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0600  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.08 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0871722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.08 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  28.97 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.37 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  30.26 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  30.22 
 
 		 247 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  31.17 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  31.51 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  26.84 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.63 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.85 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  29.6 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.19 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.04 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  30.41 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.93 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.52 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  26.54 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.33 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  27.54 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  28.34 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  27.57 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  33.11 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 604 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  28.33 
 
 		 604 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  32.63 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  32.63 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0439  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.501254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  32.63 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3705  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  27.9 
 
 		 604 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.63 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.63 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.63 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.97 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.63 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4868  extracellular solute-binding protein family 3  27.15 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.468978 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.27 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.62 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.97 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  26.32 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.65 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.06 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.77 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  29.02 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>