More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0388 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
296 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  63.51 
 
 
296 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  63.57 
 
 
296 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  54.26 
 
 
296 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  30.55 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
304 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  29.64 
 
 
310 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28.92 
 
 
329 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.86 
 
 
313 aa  105  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
311 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
311 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
311 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.19 
 
 
304 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.17 
 
 
337 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
306 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  26.77 
 
 
294 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
306 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 
296 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  27.64 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  26.01 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  29 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 
312 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  26.59 
 
 
313 aa  89  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
281 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  28.52 
 
 
273 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
302 aa  87  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  30.13 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  27.11 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  24.07 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  27.82 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  24.71 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  25.39 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.9 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0600  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0871722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.08 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1879  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  24.52 
 
 
604 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  25.84 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 
604 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  24.52 
 
 
604 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  28.83 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.61 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  25.68 
 
 
583 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  29 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1953  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.83 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.3 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5150  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109685  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0723  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.12 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.09 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  26.86 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.67 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.46 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.67 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.67 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0293  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.25 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  24.81 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.25 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.42 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.42 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>