More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2504 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 313 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  63.88 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  62.9 
 
 		 314 aa  355  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  60.78 
 
 		 317 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  59.86 
 
 		 317 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  60.42 
 
 		 317 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  59.51 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  60.07 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  61.48 
 
 		 314 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  60.07 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  59.36 
 
 		 315 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  60.07 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.7 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.7 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  60.7 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  60.7 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  60.7 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.7 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.7 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.03 
 
 		 313 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  59.01 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  58.3 
 
 		 313 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  58.3 
 
 		 313 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  59.07 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  56.03 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  55.17 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  56.38 
 
 		 311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.23 
 
 		 397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.23 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.23 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  54.23 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.23 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  54.93 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  55.16 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.2 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  55.52 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  54.23 
 
 		 406 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  53.87 
 
 		 311 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  55.16 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  55.16 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  56.18 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.36 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  57.56 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  56.77 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  53.93 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  53.57 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  55.19 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  55.72 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  55.32 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  54.44 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  56.09 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  51.67 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  53.87 
 
 		 308 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  54.51 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  50.37 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  46.73 
 
 		 301 aa  268  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  50.52 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  50.76 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  47.18 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  45.74 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  44.01 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  40.13 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  43.55 
 
 		 348 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  44.73 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  42.5 
 
 		 734 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  37.13 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  33.63 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.86 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 302 aa  99.4  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.76 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.19 
 
 		 265 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  33.61 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  33.61 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  33.61 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.93 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.93 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.93 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  33.61 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  33.61 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  33.61 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  33.61 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  33.19 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  33.19 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  33.19 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  32.19 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  32.64 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  32.77 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  30.11 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.81 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.81 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.81 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.8 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  28.83 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.81 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  28.96 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>