More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5206 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 311 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  62.07 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  63.86 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.86 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  61.07 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  61.07 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  61.07 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.07 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.07 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.07 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.07 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  60.78 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  59.29 
 
 		 317 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  59.22 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  58.93 
 
 		 317 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  63.31 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  59.14 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.57 
 
 		 311 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.57 
 
 		 311 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  61.57 
 
 		 311 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.57 
 
 		 311 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.57 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  61.57 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  59.07 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  61.57 
 
 		 406 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  58.57 
 
 		 317 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  58.57 
 
 		 317 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.06 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  56.35 
 
 		 313 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  56.35 
 
 		 313 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  56.35 
 
 		 313 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  59.64 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  55.77 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  59.29 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  58.72 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  58.72 
 
 		 310 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  58.72 
 
 		 310 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  56.86 
 
 		 313 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.73 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  57.71 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  60.5 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  55.63 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.58 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  55.43 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  55.07 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  51.51 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  51.15 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  50.81 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  49.68 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  54.14 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  52.22 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  53.33 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  52.86 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  49.5 
 
 		 301 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  51.29 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  49.82 
 
 		 295 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  47.33 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  42.7 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  41.64 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  41.84 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  42.7 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  40.23 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  43.1 
 
 		 734 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  39.86 
 
 		 337 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  38.32 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  32.94 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  33.03 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  32.18 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.63 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.07 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  30.56 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  26.14 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  25.66 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.81 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  27.24 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  29.26 
 
 		 583 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  26.55 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  28.52 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.77 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.77 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.77 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  30.54 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.33 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.97 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 		 598 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.5 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>