More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1775 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 312 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  38.72 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  35.33 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  38.46 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  34.75 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  37.4 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  34.98 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  35.5 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  35.69 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  35.43 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  35.11 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  34.24 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  35.88 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.32 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  33.45 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  32.32 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  31.25 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  32.26 
 
 		 583 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.59 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 		 604 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  32.16 
 
 		 604 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  30.55 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  32.16 
 
 		 604 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.99 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  30.24 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  31.42 
 
 		 586 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  31.1 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  30.82 
 
 		 331 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.49 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  28.94 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  32.68 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.06 
 
 		 247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  27.08 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  31.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  28.73 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.49 
 
 		 257 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.46 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.26 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.72 
 
 		 248 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.58 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.26 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.26 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  32.75 
 
 		 254 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 237 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.91 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.91 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.91 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.91 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  27.91 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.55 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.48 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  30.12 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  30.58 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  31.88 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 247 aa  99.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.34 
 
 		 513 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.51 
 
 		 248 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.83 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 249 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.83 
 
 		 266 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>