More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4320 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 337 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  37.08 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  42.26 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  45.98 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  45.14 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  39.8 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  39.69 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  40.18 
 
 		 323 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  42.16 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  42.16 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  42.32 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  42.16 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  39.22 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  40.56 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  40.98 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  38.46 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  36.92 
 
 		 604 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  36.46 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 604 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  36.56 
 
 		 604 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  36.88 
 
 		 583 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  36.29 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  34.98 
 
 		 586 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  35.02 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  32.47 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  31.89 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  33.12 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 304 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.75 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  30.4 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 248 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  30.65 
 
 		 273 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.52 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 248 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.33 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.62 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.82 
 
 		 513 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  29.14 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.19 
 
 		 260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 248 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.33 
 
 		 248 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.75 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5150  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109685  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 247 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 247 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 247 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 281 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.62 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.08 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  33.91 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.47 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  32.35 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  33.08 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  27.95 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  28.22 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0439  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.501254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  32.23 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.2 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.2 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  30.2 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.6 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  32.33 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  32.33 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.83 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.54 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>