More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0439 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0439  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
280 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.501254  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  44.85 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 
280 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  38.11 
 
 
273 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1310  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  27.67 
 
 
337 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
246 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  34.21 
 
 
254 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  26.52 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29 
 
 
263 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 
272 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  26.52 
 
 
313 aa  92.8  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  26.54 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  26.15 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.01 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  24.9 
 
 
583 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.59 
 
 
266 aa  89  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
246 aa  89  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  30.35 
 
 
251 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 
257 aa  89  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  29.88 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  28.08 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.25 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.54 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
247 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.68 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0401  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  26.72 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.3 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.87 
 
 
257 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  24.71 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  24.71 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  26.1 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.3 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  24.71 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.92 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1602  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.92 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  24.07 
 
 
586 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  32.6 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.3 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.46 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.46 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.46 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.46 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.35 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.92 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  22.68 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  25.67 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.08 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.52 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.52 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.52 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.52 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.52 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.52 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.22 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  23.79 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.94 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.94 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.94 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.63 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>