More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0594 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
257 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  98.83 
 
 
257 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  89.11 
 
 
253 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.54 
 
 
253 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.54 
 
 
253 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  72.76 
 
 
253 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  58.59 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  58.15 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  58.15 
 
 
250 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.71 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  53.78 
 
 
261 aa  271  9e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.22 
 
 
255 aa  259  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.3 
 
 
268 aa  248  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  46.97 
 
 
268 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.22 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  49.58 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  47.46 
 
 
258 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  48.09 
 
 
258 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  44.87 
 
 
265 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  47.43 
 
 
258 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  44.66 
 
 
258 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  48.15 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  45.83 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  47.81 
 
 
250 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  47.81 
 
 
250 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 
264 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  46.05 
 
 
250 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  46.86 
 
 
263 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
250 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  42.91 
 
 
257 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
250 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  45.65 
 
 
254 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 
248 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.76 
 
 
250 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  44.54 
 
 
257 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.97 
 
 
254 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.71 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.59 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.59 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.59 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.9 
 
 
261 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  43.86 
 
 
263 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  45.69 
 
 
266 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.21 
 
 
259 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.76 
 
 
260 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  44.73 
 
 
266 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
277 aa  191  9e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.49 
 
 
261 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  43.13 
 
 
257 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.83 
 
 
260 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.83 
 
 
260 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  43.03 
 
 
256 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 
264 aa  189  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1429  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.67 
 
 
261 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0594365  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
305 aa  188  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.67 
 
 
261 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4485  extracellular solute-binding protein family 3  37.16 
 
 
268 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  42.55 
 
 
259 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  41.25 
 
 
260 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  42.98 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.66 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  41.39 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  39.69 
 
 
309 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5069  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  41.31 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  43.32 
 
 
264 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  44.49 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.66 
 
 
260 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  40.66 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.66 
 
 
260 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.26 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.66 
 
 
260 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.66 
 
 
260 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.66 
 
 
260 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.15 
 
 
257 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  40.15 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.67 
 
 
260 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6436  extracellular solute-binding protein family 3  36.78 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118461 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3207  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 
310 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 
260 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.76 
 
 
267 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.3 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  41.08 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5703  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
267 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  39.62 
 
 
257 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  42.08 
 
 
267 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>