More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0937 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  100 
 
 		 313 aa  616  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  62.06 
 
 		 313 aa  394  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  50.84 
 
 		 302 aa  298  8e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  49.24 
 
 		 298 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  48.35 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  40.96 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  42.26 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  40.95 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  42.4 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  41.1 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  39.8 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  42.31 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  40.32 
 
 		 583 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  39.68 
 
 		 586 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 		 604 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  41.02 
 
 		 604 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  41.02 
 
 		 604 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  35.35 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  37.4 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  36.93 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  34.24 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  36.25 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  34.14 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  31.86 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  34.42 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  32.87 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.15 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  30.79 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  31.2 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  30.14 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  30.43 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  34.01 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.85 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.84 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  30.65 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.79 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  30.95 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  30.66 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  30.57 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  32.03 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.69 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  32.03 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  30.63 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  30.56 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  30.6 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  27.82 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  32.41 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  32.86 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  32.2 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.19 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.19 
 
 		 248 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.19 
 
 		 248 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.19 
 
 		 248 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.19 
 
 		 248 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 347 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  32.48 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.9 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  30.24 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.8 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.73 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  31.78 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.05 
 
 		 247 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>