More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2363 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 304 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  32.08 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  30.18 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  33.2 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.41 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.48 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  29.7 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  32.11 
 
 		 312 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  30.22 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  29.24 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  31.64 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  29.73 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  28.08 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  31.8 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  30.2 
 
 		 583 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.62 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  29.88 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  29.75 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  30.54 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.15 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  26.14 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  29.8 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  31.3 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  29.84 
 
 		 586 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  29.5 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  26.37 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  26.37 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  26.37 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  30.93 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  28.39 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  29.8 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  29.56 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.62 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  28.39 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  27.49 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30.9 
 
 		 329 aa  89  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  27.03 
 
 		 604 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.47 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  27.8 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  28.74 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 604 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  26.64 
 
 		 604 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.12 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 250 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>