More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5578 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  34.59 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  40.16 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  39.13 
 
 		 322 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  39.66 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  36.36 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  35.69 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  35.02 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.19 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  34.6 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  34.14 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.47 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  33.57 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  35.75 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  33.09 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  30.14 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  31.75 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  36.84 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  32.12 
 
 		 251 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.84 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.75 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.62 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  28.26 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.7 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  30.36 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  29.46 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  33.03 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  29.33 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  28.62 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  27.9 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  29.78 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  31.12 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  27.9 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.56 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.9 
 
 		 485 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.9 
 
 		 485 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.31 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.79 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  28.21 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  33.77 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 513 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.43 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.4 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  28.76 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.46 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.61 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_003296  RS00359  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  34.76 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0723  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  27.71 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.9 
 
 		 490 aa  99.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.36 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.21 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>