More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3938 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 317 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  99.68 
 
 		 317 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  98.74 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  93.06 
 
 		 315 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  90.51 
 
 		 317 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  90.51 
 
 		 317 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  89.32 
 
 		 347 aa  520  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.67 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.67 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.67 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  74.67 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.67 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  74.67 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  74.67 
 
 		 328 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.65 
 
 		 313 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  67.51 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  67.51 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  66.56 
 
 		 313 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  65.79 
 
 		 313 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  60.26 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  59.47 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  58.16 
 
 		 312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  58.66 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  59.66 
 
 		 313 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.93 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  52.29 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  53.38 
 
 		 309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  59.72 
 
 		 312 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  58.06 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  58.06 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.2 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  57.71 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  57.55 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  57.19 
 
 		 313 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.79 
 
 		 397 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.79 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  56.79 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.79 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.79 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  56.79 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  56.79 
 
 		 406 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.83 
 
 		 309 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  48.85 
 
 		 309 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  52.79 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  47.71 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  52.12 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  52.12 
 
 		 327 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  52.33 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  51.74 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  47.74 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  50.19 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  45.57 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  51.16 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  49.61 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  44.08 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  47.49 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  45.15 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  45.39 
 
 		 341 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  42.4 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  38.69 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  37.78 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  36.33 
 
 		 734 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  37.12 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  36.43 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.65 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  30.2 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.36 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  29.09 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.73 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.73 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.73 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.17 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.17 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.17 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.75 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.75 
 
 		 266 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.75 
 
 		 266 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.87 
 
 		 265 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  25.62 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.6 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.6 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.6 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  26.24 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.59 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.43 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.43 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  28.39 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>